fichamento 5

ROSA G.J.M; REVISTA BRASILEIRA DE ZOOTECNIA; R. BRAS. ZOOTEC. V.36  SUPL.0 VIÇOSA JUL. 2007

Da mesma maneira que qualquer outro estudo de mapeamento de QTL, estudos de genética genômica requerem, por exemplo, a escolha das raças ou linhagens, bem como a estratégia de cruzamentos a ser utilizada, como retrocruzamento, F₂, etc. Além disso, estudos de expressão gênica envolvem também a escolha cuidadosa do(s) tecido(s) ou tipo(s) de célula(s), bem como o(s) estágio(s) de desenvolvimento a serem amostrados. Após a seleção dos indivíduos a serem utilizados nos experimentos com microarrays, outro importante passo no delineamento experimental se faz necessário, especialmente se for utilizada a tecnologia de hibridizações competitivas. Nestes casos, tem-se ainda que se decidir como as diferentes amostras serão pareadas e marcadas para cada hibridização.

Nesta apresentação são discutidas estratégias de delineamento para experimentos com microarray em estudos de genética genômica com diferentes objetivos experimentais, tais como a comparação dos padrões de expressão gênica de diferentes grupos genotípicos, o mapeamento de eQTL, ou a estimação de herdabilidades dos padrões de expressão. O planejamento de um delineamento experimental eficiente geralmente envolve uma sub-amostragem dos indivíduos disponíveis (denominada fenotipagem seletiva), para o posterior pareamento e marcação das amostras (referente às hibridizações competitivas em cada lâmina de microarray).